Bitki Moleküler Biyolojisi ve Bitki Biyoteknolojisi Laboratuvarında güncel yöntemler kullanarak tarımsal verim kayıplarının önlenmesi ve/veya azaltılması, çevresel stres koşullarına (kuraklık, metal kirliliği, yüksek ve düşük sıcaklık, herbisit vb) toleranslı tarımsal bitkilerin elde edilmesi ve bu koşullar altında hem tarımsal bitkilerde hem de model bitki Arabidopsis thaliana’da yapısal, gelişimsel, fizyolojik ve savunma ile ilgili süreçlerin işleyişi omiks teknolojileri ile (genomik ve proteomik düzeyinde) tanımlanmasına yönelik çalışmalar yürütülmektedir.
• İklim dolabı
• Derin dondurucular (-20°C)
• Ultra Saf Su (Distile su) Cihazı
• Çeker Ocak /Nüve
• Güvenlik Kabini (Laminar Flow)
• Buzdolabı
• UV sterilizasyon kabini
• Protean İ12IEF System
• Elektroforez ekipmanı ve güç kaynağı
• Real-Time qPCR Cihazı
• Santrifüj cihazı
• Spektrofotometre
• Nanodrop
• Fluorometre
• Çalkalayıcı
• Kuru blok ısıtıcı
• Çoklu vorteks
• VWR Ultrasonik Su Banyosu
• Terazi
• Karıştırıcı
• pH metre
• Mikrodalga fırın
• Bulaşık makinası
Prof. Dr. Yasemin EKMEKÇİ
Prof. Dr. Nuran ÇİÇEK
Dr. Şeküre ÇULHA ERDAL
Y.L. Öğrencisi Efe DALLI
Y.L. Öğrencisi Seda YİRMİBEŞ
Y.L. Öğrencisi Omar Khalid NASHAT
Y.L. Öğrencisi Kamile Hazal TATAR
Doç. Dr. Ceyhun KAYIHAN (Başkent Üniversitesi)
Dr. Öğr. Üyesi Özlem ARSLAN (Giresun Üniversitesi)
Dr. Ayşe Suna BALKAN NALÇAİYİ (Necmettin Erbakan Üniversitesi)
• Tuz Ön Uygulaması ile Bor Toleransı Kazandırılmış Arabidopsis thaliana Bitkisinde Transkriptomik ve Proteomik Cevabın Elde Edilmesi, Hacettepe Üniversitesi Bilimsel Araştırmalar Birimi (BAP), FBA-2020-18859.
• Soya Genotiplerinin Farklı Su Rejimlerine Toleranslarında Fotokimyasal ve Antioksidatif Cevaplarının Ortaya Konulması, Hacettepe Üniversitesi Bilimsel Araştırmalar Birimi (BAP), FBA-2019-17326.
• İklim Değişikliğinin İç Anadolu Bozkır Bitkileri Üzerine Olası Etkilerinin Fizyo-ekolojik Yaklaşımlar ile Ortaya Konulması, TÜBİTAK, 119Z358.
• İzmir İklim Değişikliği ve Bitkiler Projesi- İzmir İlinde Ekolojik Araştırmalar Yürütülmesine Yönelik Kurumlar Arası İşbirliği Protokolü, İzmir Büyükşehir Belediyesi - Hacettepe Üniversitesi.
• Ayçiçeğinin Yerel (Helianthus annuus L.) ve Atasal (Helianthus agrophyllus Alchemy) Genotiplerinde Kuraklık Toleransı ile İlişkili Proteom Değişimlerinin Ortaya Konulması, Hacettepe üniversitesi, Bilimsel Araştırmalar Birimi (BAP), Hızlı Destek Projesi, (Temmuz 2018).
• Polifazik Klorofil a Fluoresans Kinetiklerindeki Değişimlere Bağlı Olarak Aspir (Carthamus tinctorius L.) Genotiplerinin kuraklık toleranslarının Belirlenmesi ve Kuraklık toleransı ile İlişkili Proteom Değişimlerinin Ortaya Konulması, TUBİTAK, Proje No: KBAG-214Z058 (Haziran 2018).
• Ayçiçeğinde (Helianthus annuus L.) Kuraklığa Dayanıklı Genetik Materyalin Belirlenmesi ve Islah Programlarında Kullanılması, TÜBİTAK, Proje No: TOVAG -1130926 (Nisan 2017).
• Sarıçam (Pinus sylvestris L.)’ın Bazı Orijinlerinin Kuraklık Stresine Morfolojik ve Fizyolojik Tepkileri, T.C. Çevre ve Orman Bakanlığı, Orman Ağaçları ve Tohum Islah Araştırma Müdürlüğü, Proje No: ANK–034 1625; 23.6301 / 2010–2012 (2013).
• Türkiye Tescilli Nohut Çeşitlerinin Soğuk ve Kuraklık Toleranslarının Belirlenmesinde Fizyolojik ve Moleküler Yaklaşımlar, Hacettepe Üniversitesi, Bilimsel Araştırmalar Projesi, Proje No: 80160 1007 (2009).
• Değişik Islah Zonlarından Örneklenen Anadolu Karaçamı (Pinus nigra Arnold. ssp. nigra var. caramanica (Loudon Rehder) Orjinlerinin Dona ve Kuraklığa dayanıklılıklarının Belirlenmesi, T.C. Çevre ve Orman Bakanlığı, Orman Ağaçları ve Tohum Islah Araştırma Müdürlüğü, Proje No: ANK-026 1618–23.1612/2004-2006, ODC:181.221) (2008).
• Türkiye’de Yetiştirilen Bazı Buğday Çeşitlerinde Sıcaklık ve Herbisit Stresine Karşı Toleransta Antioksidant Savunma Sistemlerinin Rolü, Hacettepe Üniversitesi, Güdümlü Araştırma Projesi, Proje No: 02 G0 80 (2009).
• Yabani Buğday (Aegilops L.) Türlerinin ve Kültür Buğday (Triticum L.) Çeşitlerinin Bazılarında Sıcaklık ve Herbisit Stresleri Arasındaki Çapraz Toleransın Belirlenmesinde Antioksidan Enzimlerin Rolü, DPT Projesi, Proje No: 00K 120 210 (2008).
• Soğuk ve Kuraklık Stresine Karşı Dayanıklı Nohut (Cicer arietinum L.) Çeşit ve Hatlarının Karakterizasyonu, Hacettepe Üniversitesi, Bilimsel Araştırma Projesi, Proje No: 03 02 601 001, (2007).
• Ağır Metal ve Boya Toksititesine Karşı Toleranslı Mısır Çeşitlerinin Belirlenmesi, İçsel Savunma Mekanizmalarının Açıklanması ve Belirlenen Çeşitlerin Atıklarıyla (yaprak ve koçan) Atık Suların Arıtılması, Hacettepe Üniversitesi, Bilimsel Araştırma Projesi, Proje No: 02 02 602 1013 (2007).
• Triticum L.’un Bazı Çeşitleri ve Aegilops L’un Bazı Türlerinde Yüksek Sıcaklığa Toleransın Belirlenmesinde Kloroplast Yüksek Sıcaklık Şok Proteinleri, Hacettepe Üniversitesi, Güdümlü Araştırma Projesi, Proje No: 02 G0 45 (2007).
A. Science Citation Index (SCI) Kapsamındaki Dergilerde Yayınlanan
A1. Çulha Erdal, Ş., Ekmekçi, Y., Exploration of drought tolerance and recovery potential of safflower genotypes based on chlorophyll a fluorescence kinetics, Acta Physiologiae Plantarum (İncelemede).
A2. Baran, U., Ekmekçi, Y., Physiological, photochemical, and antioxidant responses of wild and cultivated Carthamus species exposed to nickel toxicity and evaluation of their usage potential in phytoremediation, Environmental Science and Pollution Research, 29, (January) 4446–4460 2022. https://doi.org/10.1007/s11356-021-15493-y.
A3. Çulha Erdal, Ş., Eyidoğan, F., Ekmekçi, Y., Comparative physiological and proteomic analysis of cultivated and wild safflower response to drought stress and re-watering, Physiology and Molecular Biology of Plants, 27, (February) 281-295, 2021. https://doi.org/10.1007/s12298-021-00934-2.
A4. Ekmekçi, Y., Çulha Erdal, Ş., Balkan Nalçaiyi, A.S., Çiçek, N., The acquisition of boron tolerance by salt pretreatment in two sunflower cultivars, Turkish Journal of Botany, 44, (March) 153-166, 2020. DOI:10.3906/bot-1910-26.
A5. Çiçek, N., Kalaji, H.M., Ekmekçi, Y., Probing the photosynthetic efficiency of some European and Anatolian Scots pine populations under UV-B radiation using polyphasic chlorophyll a fluorescence transient, Photosynthetica, 58 (SI), (January), 283-293, 2020. DOI: 10.32615/ps.2019.151.
A6. Arslan, Ö., Balkan Nalçaiyi, A.S., Çulha Erdal, Ş., Pekcan, V., Kaya, Y., Çiçek, N., Ekmekçi, Y., Analysis of drought response of sunflower inbred lines by chlorophyll a fluorescence induction kinetics, Photosynthetica, 58 (SI), (January), 163-172, 2020. DOI: 10.32615/ps.2019.171.
A7. Çiçek, N., Pekcan, V., Arslan, Ö., Çulha Erdal, Ş., Balkan Nalçaiyi, A.S., Çil, A.N., Şahin, V., Kaya, Y., Ekmekçi, Y., Assessing drought tolerance in field-grown sunflower hybrids by chlorophyll fluorescence kinetics, Brazilian Journal of Botany, 42 (2), (June), 249–260, 2019. https://doi.org/10.1007/s40415-019-00534-1.
A8. Arslan, Ö., Eyidoğan, F., Ekmekçi, Y., Freezing tolerance of chickpea: biochemical and molecular changes at vegetative stage, Biologia Plantarum, 62(1), 140–148, 2018.
A9. Semerci, A., Çiçek, N., Karahan, F.A., Özyürek, E., Kaşko Arıcı, Y., Ekmekçi, Y., Some growth and chlorophyll fluorescence parameters of black and hybrid poplar clones under water stress, Turkish Journal of Agriculture and Forestry, 41, 348-356, 2017.
A10. Semerci, A., Semerci, H., Çalişkan, B., Çiçek, N., Ekmekçi, Y., Mencuccini, M., Morphological and physiological responses to drought stress of European provenances of Scot pine, European Journal of Forest Research, 136, 91-104, 2017.
A11. Eyidoğan, F., Terzioğlu, S., Ekmekçi, Y., Does sublethal temperature treatment provide any tolerance in tetraploid wild and durum wheat seedlings exposed to lethal heat stress? Fresenius Environmental Bulletin, 25(12a), 6045-6053, 2016.
A12. Kaya, Y., Balkan Nalcaiyi, A.S., Çulha Erdal, Ş., Arslan, O., Cicek, N., Pekcan, V., Yılmaz, I.M., Evci, G., Ekmekçi, Y., Evaluation of male inbred lines of sunflower (Helianthus annuus L.) for resistance to drought via chlorophyll fluorescence, Turkish Journal of Field Crops, 21(2), 162-173, 2016.
B. SCI kapsamı dışında olup, uluslararası indekslerin kaydettiği hakemli ve süreli dergilerde yer alan makale ve diğer yayınlar:
B1. Pekcan, V., Evci, G., Yilmaz, İ.M., Balkan Nalcaiyi, A.S., Çulha Erdal, Ş., Cicek, N., Ekmekci, Y., Kaya, Y., Effects of drought on morphological traits of some sunflower lines, Ekin Journal of Crop Breeding and Genetics, 2(2), 54-68, 2016.
B2. Pekcan, V., G. Evci, M. I. Yilmaz, A. S. Balkan Nalcaiyi, Ş. Çulha Erdal, N. Cicek, Ekmekci, Y., Kaya, Y., Drought tolerance of some sunflower inbred lines and effects on some yield traits, Agriculture & Forestry, 61(4), 101-107, 2015.
B3. Pekcan, V., Evci, G., Yilmaz, M.I., Balkan Nalcaiyi, A.S., Çulha Erdal, Ş., Cicek, N., Ekmekci, Y., Kaya, Y. Evaluating foliar responses of sunflower genotypes under drought stress. International Journal of Scientific Research in Science and Technology, 1(6), 54-63, 2015.
C. Uluslararası bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında (Proceedings) basılan bildiriler:
C1. Balkan Nalcaiyi, A.S., Çulha Erdal, Ş., Gündüz, O., Pekcan, V., Arslan, O., Yılmaz, I.M., Cicek, N., Kaya, Y., Ekmekçi, Y., Quantification of drought tolerance levels of sunflower inbred lines by means of chlorophyll-a fluorescence, 19. International Sunflower Congress (ISC-2016), Edirne, Turkey, 29 May-3 June 2016, 744-757. (Bildiri kitabında tam metin)
C2. Pekcan, V., Evci, G., Yılmaz, I.M., Balkan Nalcaiyi, A.S., Çulha Erdal, Ş., Cicek, N., Arslan, O., Ekmekçi, Y., Kaya, Y., Effects of drought stress on sunflower stems and roots, International Conference on Chemical, Agricultural and Life Sciences (CALS-16) Bali, Indonesia, 4-5 February 2016, 53-59. (Bildiri kitabında tam metin)
C3. Pekcan, V., Evci, G., Yilmaz, M.I., Ekmekci, Y., Arslan, Ö., Balkan Nalcaiyi, A.S., Çulha Erdal, Ş., Cicek, N., Kaya, Y., Evaluating foliar responses of sunflower genotypes under drought stress. International Journal of Scientific Research in Science and Technology, 1st International Symposium of Applied Biology-CIBA 2015, Algeria, Oran, 29 November- 01 December 2015, [6(1), 54-63]. (Bildiri kitabında tam metin)
D. Uluslararası bilimsel toplantılarda sunulan ve özeti basılan bildiri ve posterler:
D1. Khalid Nashat, O., Dallı, E., Yirmibeş, S., Çulha Erdal,Ş., Çiçek, N., Ekmekçi, Y., Revealing of flooding tolerance levels of soybean genotypes at the early seedling stage using morpho-physiological characters. III. Balkan Agricultural Congress- AGRIBALKAN 2021- 29 August – 01 September 2021, Edirne, Turkey. (Sözlü bildiri)
D2. Çulha Erdal,Ş., Yirmibeş, S., Dallı, E., Khalid Nashat, O., Çiçek, N., Ekmekçi, Y., A rapid screening the drought tolerance levels of soybean cultivars (Glycine max L.). III. International Agricultural, Biological & Life Science Conference, Edirne, Turkey, 1-3 September 2021. (Sözlü bildiri)
D3. Baran, U., Ekmekçi, Y., Aspir Genotiplerinin Nikel Fitoremediasyonunda Kullanılma Potansiyelleri; Nikel Akümülasyonu, Translokasyonu ve Antioksidant Enzim Yanıtları. 9th Internatıonal Symposium on Ecology and Environmental Problems, İSEEP 2019 ANTALYA-TURKEY, 01-03 November 2019. (Sözlü bildiri)
D4. Çulha Erdal, Ş., Balkan Nalcaiyi, A.S., Otu Borlu H., Ekmekçi, Y., Does salt pre-treatment provide amelioration effect on toxic boron levels in two sunflower cultivars? Proceeedings of International Agricultural, Biological & Life Science Conference, Edirne, Turkey, September 2-5, 2018. (Sözlü bildiri)
D5. Balkan Nalcaiyi, A.S., Çulha Erdal, Ş., Ekmekçi, Y., Proteome analysis of sunflower leaf responses to drought stress and recovery, VII. International Molecular Biology and Biotechnology Congress, Konya, Turkey, 25-27 April 2018. (Sözlü bildiri)
D6. Çiçek, N., Pekcan, V., Arslan, O., Çulha Erdal, Ş., Balkan Nalçaiyi, A.S., Çil, A.N., Şahin, V., Ekmekçi, Y., Assessing drought tolerance of sunflower inbred lines by PSII photochemical efficiency, III. International Plant Breeding Congress, Kyrenia (Girne), TRNC (KKTC), October 15 - 19, 2017, pp.81. (Poster)
D7. Arslan, Ö., Ekmekçi, Y., Oxidative stress induced antioxidant enzyme activities of high temperature treated chickpea seedlings, 13rd Plant Oxygen Group (POG) Meeting, Kusadasi, TURKEY, September 10-13, 2017. (Poster)
D8. Çulha Erdal, Ş., Eyidoğan, F., Ekmekçi, Y., Drought tolerance in a wild safflower: Effect on photosynthetic mechanism and role of antioxidant defences, 13rd Plant Oxygen Group (POG) Meeting, Kusadasi, TURKEY, September 10-13, 2017. (Poster)
D9. Nalçaiyi, A.S., Ekmekçi, Y., Changes in photosynthetic mechanism, water content and pigment status at sunflower genotypes as a result of drought, 13rd Plant Oxygen Group (POG) Meeting, Kusadasi, TURKEY, September 10-13, 2017. (Poster)
D10. Arslan, Ö., Çulha-Erdal, Ş., Balkan-Nalçaiyi, A.S., Eyidoğan, F., Ekmekçi, Y., Influence of supra-optimal boron levels with salt pre-treatment on antioxidant enzyme activities, membrane damage and ion concentrations of two safflower cultivars, Plant Biology Europe, EPSO/FESPB Congress, Prague, Czech Repuclic, 26-30 June 2016. (Poster)
D11. Balkan-Nalçaiyi, A.S., Çulha-Erdal, Ş., Ekmekçi, Y., Different responses on drought tolerance and post-drought recovery in sunflower genotypes associated with H2O2 scavenging ezymes and aldose reductase activity, Plant Biology Europe, EPSO/FESPB Congress, Prague, Czech Repuclic, 26-30 June 2016. (Poster)
D12. Çulha-Erdal, Ş., Balkan-Nalçaiyi, A.S., Eyidoğan, F., Ekmekçi, Y., Probing the responses of safflower genotypes (Carthamus tinctorius L.) under drought stresses and re-watering using performance indexes, Plant Biology Europe, EPSO/FESPB Congress, Prague, Czech Repuclic, 26-30 June 2016. (Poster)
D13. Çiçek, N., Çulha-Erdal, Ş., Balkan-Nalçaiyi, A.S., Ekmekçi, Y., Does The H2O2-pretreatment provides any protection against UV-B radiation in two soybean genotypes? Plant Biology Europe, EPSO/FESPB Congress, Prague, Czech Repuclic, 26-30 June 2016. (Poster)
D14. Arslan, O., Balkan Nalcaiyi, A.S., Çulha Erdal, Ş., Evci, G., Pekcan, V., Yılmaz, I.M., Cicek, N., Kaya, Y., Ekmekçi, Y., The estimating drought stress tolerances of sunflower inbred lines under controlled environmental conditions, 19. International Sunflower Congress (ISC-2016), Edirne, Turkey, 29 May-3 June 2016. (Sözlü bildiri)
D15. Pekcan, V., Evci, G., Yilmaz, M.I., Balkan Nalcaiyi, A.S., Çulha Erdal, Ş., Cicek, N., Ekmekci, Y., Kaya, Y., Drought effects on yield traits of some sunflower inbred lines, 6th International Scientific Agricultural Symposium, Jahorina, Bosnia and Herzegovina, 15-18 October 2015. (Sözlü bildiri)
D16. Pekcan, V., Evci, G., Yilmaz, M.I., Balkan Nalcaiyi, A.S., Çulha Erdal, Ş., Cicek, N., Ekmekci, Y., Kaya, Y., Effects of drought on morphological traits of some sunflower lines, Proc. of 2. International Plant Breeding Congress. 1-5 November, Antalya, 158, 2015. (Sözlü Bildiri)
E. Ulusal toplantılarda sunulan ve özeti basılan bildiriler:
E1. Çiçek, N., Ekmekçi, Y., İki farklı su rejiminde soya bitkisinin fotosentetik kapasitesinin karşılaştırılması, UBFS-2018 III. Uluslararası Katılımlı Bitki Fizyolojisi Sempozyumu, Çanakkale, 26-29 Eylül 2018. (Sözlü Bildiri)
E2. Baran, U., Ekmekçi, Y., Yerel (Carthamus tinctorius L.) ve yabani (Carthamus oxycantha M.Bieb.) aspir genotiplerinin artan nikel düzeylerindeki büyüme ve fotokimyasal yanıtları, UBFS-2018 III. Uluslararası Katılımlı Bitki Fizyolojisi Sempozyumu, Çanakkale, 26-29 Eylül 2018. (Sözlü Bildiri)
E3. Çulha Erdal, Ş., Balkan Nalçaiyi, A.S., Eyidoğan, F.İ., Ekmekçi, Y., Kuraklık ve yeniden sulama uygulamalarına maruz kalan aspir genotiplerinde sekonder metabolit, oksidatif hasar ve enzim aktiviteleri, 18. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, Tarımsal Biyoteknoloji Seksiyonu, Konya, 18-19 Aralık 2015, s.247. (Poster)
E4. Balkan Nalçaiyi, A.S., Çulha Erdal, Ş., Ekmekçi, Y., Kuraklık ve yeniden sulama uygulamalarının Ayçiçeği çeşitlerinde fotokimyasal etkinlik üzerine etkisi, 18. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, Tarımsal Biyoteknoloji Seksiyonu, Konya, 18-19 Aralık 2015, s.210. (Poster)
E5. Çiçek, N., Ekmekçi, Y., Soya çeşitlerinin kuraklık toleranslarının JIP-test ile taranması, 18. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, Tarımsal Biyoteknoloji Seksiyonu, Konya, 18-19 Aralık 2015, s.237. (Poster)
Biyoloji Bölümü Ekoloji Anabilim Dalı [Fonksiyonel Ekoloji Laboratuvarı (FEL)]
HÜNİTEK
TÜBİTAK
Kocaeli Üniversitesi-DEKART Proteomiks Laboratuvarı
Başkent Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik
T.C. Tarım ve Ormancılık Bakanlığı
T.C. Çevre, Şehircilik ve İklim Değişikliği Bakanlığı