Biyofizik Laboratuvarı

Hakkında

Araştırma Olanakları

•    Laminar Kabin, Class II Tip (Biolab, Faster, BH 2004)
•    ELISA plak okuyucusu (Biochrom, EZ Read 400, Cambridge)
•    Su Banyosu 14 Lt Dijital GFL (1003)
•    CO2 İnkübatörü (Heracell 150)
•    Floresan ataşmanlı inverted mikroskop (Olympus IX70 Inverted Mikroskop, Japan)
•    Santrifüj (Hettich Universal 32)
•    Mikrotom (Leica 820, Jung Histocut)
•    Etüv (Termal, G11420SD)
•    Ultra saf su cihazı (Nanopure Diamond, Barnstead)
•    Distile su cihazı (MP, Minipure)
•    Santrifüj mini (IsoLAB, GmbH)
•    Gel Analyser
•    Thermal Cycler
•    Kamera ataçmanlı floransan mikroskop
•    Işık mikroskobu

Araştırmacılar

•    Prof. Dr. Mehmet Ali Onur
•    Doç. Dr. Ö. Aylin Gürpınar
•    Dr. Öğr. Üyesi Esin Çetin
•    Dr. Öğr. Üyesi Handan Sevim
•    Araş. Gör. Dr. Hanife Güler Tanır  
 

Devam Eden Projeler

•    H.Ü. BAP PROJE: ID: 18650 Proje Kodu: FHD-2020-18650 Proje Türü: Hızlı Destek Proje Adı: Farklı arı venomu bileşenlerinin UVA ve UVB ışınlarına karşı gösterdiği fotokoruyucu etkilerinin in vitro ortamda araştırılması    
•    H.Ü. BAP PROJE: ID: 18273 Proje Kodu: FYL-2019-18273 Proje Türü: Y.Lisans Destek Proje Adı: E vitamininin alfa-tokoferol ve alfa-tokotrienol formlarının beyinde oluşan beta amiloid plak birikimine karşı koruyucu etkilerinin karşılaştırılması    
•    FHD-2020-18482, Bitkisel madde içerikli hidrojel ve mikrobiyal selülozların antimikrobiyal ve antibiyofilm etkileri ile sitotoksik potansiyellerinin araştırılması, 2020-2022
•    FUI-2020-18907, HPV8 E6E7 proteinlerinin onkojenik etkilerinin incelenmesi, 2020-2021
•    Aebp1 / Aclp Gen İşlevinin Araştırılması, TÜBİTAK, 119S521, Ulusal.
•    Hemofagositik Sendrom Hasta Örneklerinde Mezenkimal Kök Hücrelerin İmmün Modülatör Etkisinin Gösterilmesi, TÜBİTAK, 219S897, Ulusal.
 

Tamamlanan Projeler

•    H.Ü. BAP PROJE: ID: 885 Proje Kodu: 013 01 601 002 Proje türü: Kapsamlı Araştırma Destek Proje Adı: Mezenşimal kök hücre kökenli farklılaştırılmış işaretli hücrelerin ektopik göçü    
•    H.Ü. BAP PROJE: ID: 11684 Proje Kodu: FHD-2016-11684 Proje Türü: Hızlı Destek Destek Proje Adı:    Bal Arısı Venomunun Adipoz Doku Kökenli Kök Hücreler Üzerine Etkisi    
•    H.Ü. BAP PROJE: ID: 7428 Proje Kodu: FDK-2015-7428 Proje Türü: DoktoraDestek Proje Adı:Mezenşimal Kök Hücrelerden Farklılaştırılmış İşaretli Kardiyomiyositlerin in vivo İmplantasyon Sonrası Ektopik Göç Potansiyelinin İncelenmesi    
•    THD-2019-18131, Human Papilloma Virüs Enfeksiyonunun Wnt/Beta-Katenin Sinyal Yolu, Otofaji ve Apoptozis Üzerine Etkisi, 2019-2020
•    THD-2018-17493, Term ve preterm yeni doğanlardan alınan bukkal yayma örneklerinde hücre morfolojisi ve fizyolojisinin araştırılması Wntbetakatenin sinyal yolu ve apoptosis, 2018-2020
•    FHD-2018-17008, Dextran- 9Z 11E Konjuge Linoleik Asit konjugatının hazılanması ve karakterizasyonu ile farklı kanser hücrelerinde Wntbetakatenin sinyal yolu ve apoptozis üzerine etkisinin incelenmesi, 2018-2019
•    Ailevi hemofagositik lenfohistiyositoz hastalığı araştırmalarına temel oluşturmak üzere perforin defektli hücre hattı modeli geliştirilmesi, Hacettepe Üniversitesi Bilimsel Araştırmalar Birimi, 013 D12 601 001 no.lu proje, 2013-2015, Yardımcı araştırmacı, Ulusal.
•    Mezenkimal Kök Hücrelerin Hemofagositik Sendrom Klinik Uygulamalarına Temel Oluşturmak Üzere İmmün Modülatör Etkisinin in vitro Modelde İncelenmesi, TÜBİTAK, 114S057 nolu proje, Ulusal.
•    İnsan Yağ Dokusu Mezenkimal Kök Hücrelerinde Notch Sinyal Yolunun Araştırılması, Hacettepe Üniversitesi Bilimsel Araştırmalar Birimi, FHD-2015-5324 nolu proje, Ulusal.
•    Fungal kaynaklı Bassiatin'in (3r, 6r) MCF7 ve Hmec hücre hatları üzerindeki etkisinin araştırılması, TÜBİTAK, 215S096 nolu proje, 29500TL, 01.01.2016-21.02.2017, Yardımcı araştırmacı, Ulusal.

Yayınlar

•    Beksac MS, Donmez HG. Impact of hydroxychloroquine on the gestational outcomes of pregnant women with immune system problems that necessitate the use of the drug. J Obstet Gynaecol Res. 2020. doi:10.1111/jog.14561
•    Donmez HG. β-Catenin immunocytochemical reactivity in cervicovaginal smears during regular menstrual cycles. Asian Biomedicine 2020;14(5):187-194. doi:10.1515/abm-2020-0027
•    Donmez HG, Sahal G, Akgor U, Cagan M, Ozgul N, Beksac MS. The relationship between the presence of HPV infection and biofilm formation in cervicovaginal smears. Infection 2020 Oct;48(5):735-740. doi: 10.1007/s15010-020-01478-5.
•    Akbay, E., Sevim, H., Gurpinar, Ö.A., Günaydın, S., Onur, M.A. Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells to Improve Damaged Heart Function after Modified Myocardial Infarction Rat Model, Hacettepe Journal of Biology and Chemistry, 2016, , 44 [3], 283–292.
•    Atalay Ö, Sevim H,  Karahisar Turan S, Onur M A, Gürpınar Ö A. The effects of mesenchymal stem cells on the structure and contractile force of the carotid artery in a rat aneurysm model. Turk J Med Sci. 2017;47(5):1634-1641. doi: 10.3906/sag-1701-183.
•    Günaydın Y, Sevim H, Tanyolaç D, Gürpınar Ö A. Ozonated Olive Oil with a High Peroxide Value for Topical Applications: In-Vitro Cytotoxicity Analysis with L929 Cells.   Ozone: Science & Engineering, 2018, 40.1: 37-43.
•    Akay C, Tanış MÇ, Sevim H. Effect of artificial saliva with different pH levels on the cytotoxicity of soft denture lining materials. Int J Artif Organs. 2017;40(10):581-588. doi: 10.5301/ijao.5000614. Epub 2017 Jun 27.
•    Sevim, H., Akbay, E., Gürpınar, ÖA., Günaydın, S., Onur, MA. Cardiomyogenic Gene Expression Profile of 5-Azacytidine- Treated Rat Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells. Hacettepe Journal of Biology and Chemistry, 2017, 45 (3), 343–350.
•    Sevim H, Kocaefe YÇ, Onur MA, Uçkan-Çetinkaya D, Gürpınar ÖA. Bone marrow derived mesenchymal stem cells ameliorate inflammatory response in an in vitro model of familial hemophagocytic lymphohistiocytosis 2. Stem Cell Res Ther. 2018;9(1):198.
•    Çakırbay Tanış M, Akay C, Sevim H. Cytotoxicity of long-term denture base materials. Int J Artif Organs. Int. 2018;41(10):677-683. doi: 10.1177/0391398818786884.
•    Akbay, E., Özenirler, Ç., Gençay Çelemli, Ö., Durukan, A. B., Onur, M. A., Sorkun, K., “Effects of poropolis on warfarin efficacy”, Kardiochirugia i Torakochirurgia Polska 2017; 14 (1): 43-46.
•    Akbay, E., Onur, M.A., Investigation of Survival and Migration Potential of Differentiated Cardiomyocytes Transplanted With Decellularized Heart Scaffold. Journal of Biomedical Materials Research Part A 2018; 9999:1-10
•    Sesli, M., Akbay, E., Onur, M.A., Decellularization of rat adipose tissue, diaphragm, and heart: a comparation of two decellularization methods. Turkish Journal of Biology 2018; 42.
•    Durukan, A.B., Akbay, E., Ünlü, A., Özdemir, A., Onur, M.A., The cytotoxic properties and apoptotic potential of N-butyl and 2-octyl cyanoacrylates used in surgical treatment of chronic venous insufficiency. Turkish Journal of Thoracic and Cardiovascular Surgery, 2019;27(2):185-19.
•    Akbay, E., Erdem, B., Ünlü, A., Durukan, A. B., Onur, M. A. Effects of N-acetyl cysteine, vitamin E and vitamin C on liver glutathione levels following amiodarone treatment in rats. Kardiochirurgia i torakochirurgia polska= Polish journal of cardio-thoracic surgery, 2019; 16(2), 88.
•    Kip, Ç., Akbay, E., Gökçal, B., Okyay Savaş, B., Onur, M.A., Tuncel, A., Colorimetric determination of tumor cells via peroxidase-like activity of a cell internalizable nanozyme: Hyaluronic acid attached-silica microspheres containing accessible magnetite nanoparticles. Colloids and Surfaces A: Physicochemical and Engineering Aspects, 2020; 124812.

Bağlantılar

Hakkında

Araştırma Olanakları

•    Laminar Kabin, Class II Tip (Biolab, Faster, BH 2004)
•    ELISA plak okuyucusu (Biochrom, EZ Read 400, Cambridge)
•    Su Banyosu 14 Lt Dijital GFL (1003)
•    CO2 İnkübatörü (Heracell 150)
•    Floresan ataşmanlı inverted mikroskop (Olympus IX70 Inverted Mikroskop, Japan)
•    Santrifüj (Hettich Universal 32)
•    Mikrotom (Leica 820, Jung Histocut)
•    Etüv (Termal, G11420SD)
•    Ultra saf su cihazı (Nanopure Diamond, Barnstead)
•    Distile su cihazı (MP, Minipure)
•    Santrifüj mini (IsoLAB, GmbH)
•    Gel Analyser
•    Thermal Cycler
•    Kamera ataçmanlı floransan mikroskop
•    Işık mikroskobu

Araştırmacılar

•    Prof. Dr. Mehmet Ali Onur
•    Doç. Dr. Ö. Aylin Gürpınar
•    Dr. Öğr. Üyesi Esin Çetin
•    Dr. Öğr. Üyesi Handan Sevim
•    Araş. Gör. Dr. Hanife Güler Tanır  
 

Devam Eden Projeler

•    H.Ü. BAP PROJE: ID: 18650 Proje Kodu: FHD-2020-18650 Proje Türü: Hızlı Destek Proje Adı: Farklı arı venomu bileşenlerinin UVA ve UVB ışınlarına karşı gösterdiği fotokoruyucu etkilerinin in vitro ortamda araştırılması    
•    H.Ü. BAP PROJE: ID: 18273 Proje Kodu: FYL-2019-18273 Proje Türü: Y.Lisans Destek Proje Adı: E vitamininin alfa-tokoferol ve alfa-tokotrienol formlarının beyinde oluşan beta amiloid plak birikimine karşı koruyucu etkilerinin karşılaştırılması    
•    FHD-2020-18482, Bitkisel madde içerikli hidrojel ve mikrobiyal selülozların antimikrobiyal ve antibiyofilm etkileri ile sitotoksik potansiyellerinin araştırılması, 2020-2022
•    FUI-2020-18907, HPV8 E6E7 proteinlerinin onkojenik etkilerinin incelenmesi, 2020-2021
•    Aebp1 / Aclp Gen İşlevinin Araştırılması, TÜBİTAK, 119S521, Ulusal.
•    Hemofagositik Sendrom Hasta Örneklerinde Mezenkimal Kök Hücrelerin İmmün Modülatör Etkisinin Gösterilmesi, TÜBİTAK, 219S897, Ulusal.
 

Tamamlanan Projeler

•    H.Ü. BAP PROJE: ID: 885 Proje Kodu: 013 01 601 002 Proje türü: Kapsamlı Araştırma Destek Proje Adı: Mezenşimal kök hücre kökenli farklılaştırılmış işaretli hücrelerin ektopik göçü    
•    H.Ü. BAP PROJE: ID: 11684 Proje Kodu: FHD-2016-11684 Proje Türü: Hızlı Destek Destek Proje Adı:    Bal Arısı Venomunun Adipoz Doku Kökenli Kök Hücreler Üzerine Etkisi    
•    H.Ü. BAP PROJE: ID: 7428 Proje Kodu: FDK-2015-7428 Proje Türü: DoktoraDestek Proje Adı:Mezenşimal Kök Hücrelerden Farklılaştırılmış İşaretli Kardiyomiyositlerin in vivo İmplantasyon Sonrası Ektopik Göç Potansiyelinin İncelenmesi    
•    THD-2019-18131, Human Papilloma Virüs Enfeksiyonunun Wnt/Beta-Katenin Sinyal Yolu, Otofaji ve Apoptozis Üzerine Etkisi, 2019-2020
•    THD-2018-17493, Term ve preterm yeni doğanlardan alınan bukkal yayma örneklerinde hücre morfolojisi ve fizyolojisinin araştırılması Wntbetakatenin sinyal yolu ve apoptosis, 2018-2020
•    FHD-2018-17008, Dextran- 9Z 11E Konjuge Linoleik Asit konjugatının hazılanması ve karakterizasyonu ile farklı kanser hücrelerinde Wntbetakatenin sinyal yolu ve apoptozis üzerine etkisinin incelenmesi, 2018-2019
•    Ailevi hemofagositik lenfohistiyositoz hastalığı araştırmalarına temel oluşturmak üzere perforin defektli hücre hattı modeli geliştirilmesi, Hacettepe Üniversitesi Bilimsel Araştırmalar Birimi, 013 D12 601 001 no.lu proje, 2013-2015, Yardımcı araştırmacı, Ulusal.
•    Mezenkimal Kök Hücrelerin Hemofagositik Sendrom Klinik Uygulamalarına Temel Oluşturmak Üzere İmmün Modülatör Etkisinin in vitro Modelde İncelenmesi, TÜBİTAK, 114S057 nolu proje, Ulusal.
•    İnsan Yağ Dokusu Mezenkimal Kök Hücrelerinde Notch Sinyal Yolunun Araştırılması, Hacettepe Üniversitesi Bilimsel Araştırmalar Birimi, FHD-2015-5324 nolu proje, Ulusal.
•    Fungal kaynaklı Bassiatin'in (3r, 6r) MCF7 ve Hmec hücre hatları üzerindeki etkisinin araştırılması, TÜBİTAK, 215S096 nolu proje, 29500TL, 01.01.2016-21.02.2017, Yardımcı araştırmacı, Ulusal.

Yayınlar

•    Beksac MS, Donmez HG. Impact of hydroxychloroquine on the gestational outcomes of pregnant women with immune system problems that necessitate the use of the drug. J Obstet Gynaecol Res. 2020. doi:10.1111/jog.14561
•    Donmez HG. β-Catenin immunocytochemical reactivity in cervicovaginal smears during regular menstrual cycles. Asian Biomedicine 2020;14(5):187-194. doi:10.1515/abm-2020-0027
•    Donmez HG, Sahal G, Akgor U, Cagan M, Ozgul N, Beksac MS. The relationship between the presence of HPV infection and biofilm formation in cervicovaginal smears. Infection 2020 Oct;48(5):735-740. doi: 10.1007/s15010-020-01478-5.
•    Akbay, E., Sevim, H., Gurpinar, Ö.A., Günaydın, S., Onur, M.A. Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells to Improve Damaged Heart Function after Modified Myocardial Infarction Rat Model, Hacettepe Journal of Biology and Chemistry, 2016, , 44 [3], 283–292.
•    Atalay Ö, Sevim H,  Karahisar Turan S, Onur M A, Gürpınar Ö A. The effects of mesenchymal stem cells on the structure and contractile force of the carotid artery in a rat aneurysm model. Turk J Med Sci. 2017;47(5):1634-1641. doi: 10.3906/sag-1701-183.
•    Günaydın Y, Sevim H, Tanyolaç D, Gürpınar Ö A. Ozonated Olive Oil with a High Peroxide Value for Topical Applications: In-Vitro Cytotoxicity Analysis with L929 Cells.   Ozone: Science & Engineering, 2018, 40.1: 37-43.
•    Akay C, Tanış MÇ, Sevim H. Effect of artificial saliva with different pH levels on the cytotoxicity of soft denture lining materials. Int J Artif Organs. 2017;40(10):581-588. doi: 10.5301/ijao.5000614. Epub 2017 Jun 27.
•    Sevim, H., Akbay, E., Gürpınar, ÖA., Günaydın, S., Onur, MA. Cardiomyogenic Gene Expression Profile of 5-Azacytidine- Treated Rat Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells. Hacettepe Journal of Biology and Chemistry, 2017, 45 (3), 343–350.
•    Sevim H, Kocaefe YÇ, Onur MA, Uçkan-Çetinkaya D, Gürpınar ÖA. Bone marrow derived mesenchymal stem cells ameliorate inflammatory response in an in vitro model of familial hemophagocytic lymphohistiocytosis 2. Stem Cell Res Ther. 2018;9(1):198.
•    Çakırbay Tanış M, Akay C, Sevim H. Cytotoxicity of long-term denture base materials. Int J Artif Organs. Int. 2018;41(10):677-683. doi: 10.1177/0391398818786884.
•    Akbay, E., Özenirler, Ç., Gençay Çelemli, Ö., Durukan, A. B., Onur, M. A., Sorkun, K., “Effects of poropolis on warfarin efficacy”, Kardiochirugia i Torakochirurgia Polska 2017; 14 (1): 43-46.
•    Akbay, E., Onur, M.A., Investigation of Survival and Migration Potential of Differentiated Cardiomyocytes Transplanted With Decellularized Heart Scaffold. Journal of Biomedical Materials Research Part A 2018; 9999:1-10
•    Sesli, M., Akbay, E., Onur, M.A., Decellularization of rat adipose tissue, diaphragm, and heart: a comparation of two decellularization methods. Turkish Journal of Biology 2018; 42.
•    Durukan, A.B., Akbay, E., Ünlü, A., Özdemir, A., Onur, M.A., The cytotoxic properties and apoptotic potential of N-butyl and 2-octyl cyanoacrylates used in surgical treatment of chronic venous insufficiency. Turkish Journal of Thoracic and Cardiovascular Surgery, 2019;27(2):185-19.
•    Akbay, E., Erdem, B., Ünlü, A., Durukan, A. B., Onur, M. A. Effects of N-acetyl cysteine, vitamin E and vitamin C on liver glutathione levels following amiodarone treatment in rats. Kardiochirurgia i torakochirurgia polska= Polish journal of cardio-thoracic surgery, 2019; 16(2), 88.
•    Kip, Ç., Akbay, E., Gökçal, B., Okyay Savaş, B., Onur, M.A., Tuncel, A., Colorimetric determination of tumor cells via peroxidase-like activity of a cell internalizable nanozyme: Hyaluronic acid attached-silica microspheres containing accessible magnetite nanoparticles. Colloids and Surfaces A: Physicochemical and Engineering Aspects, 2020; 124812.

Bağlantılar