Biyokimya Laboratuvarı

Hakkında

Biyokimya bütün canlıların yapısında yer alan kimyasal maddeleri ve canlının yaşamı boyunca sürüp giden kimyasal süreçleri inceleyen bilim dalıdır. Laboratuvarımızda biyokimya alanında pek çok çalışma yürütülmektedir. Doğal veya sentetik materyaller kullanarak biyolojik sistemlerle etkileşime girebilecek malzemelere biyomalzemeler denir. Laboratuvarımızda özellikle doku mühendisliği, yara iyileşmesi ilaç taşınımı ve salımı gibi biyomedikal alanlarda son zamanlarda çok büyük önem kazanan biyomalzemelerin geliştirilmesi için çalışmalar yapılmaktadır.

Araştırma Olanakları

Hassas terazi

Santrifüj

Etüv                                               

Mikrodalga Fırın

Elektroforezler                         

 Doku Homojenizatörü

Çalkalayıcı Blok    

Çalkalamalı Isıtıcılı Kuru Blok       

-20 Dondurucular

+4 Soğutucu                                        

Rotator

PCR

Manyetik karıştırıcılar

Homojenizatör

Peristaltik pompa

Mikroskop

Araştırmacılar

Doç. Dr. Işık Perçin Demirçelik

Gülşen Bayrak (Doktora öğrencisi)

Simge Varlık (Doktora öğrencisi)

Serpil Metin (Doktora öğrencisi)

Feyza Keleş (Yüksek lisans öğrencisi)

Selin Uygun Özel (Yüksek lisans öğrencisi)

Başak Kurin (Yüksek lisans öğrencisi)

Devam Eden Projeler

Tamamlanan Projeler

TÜBİTAK 1003- 118Z601- Ağır Metal Biyosorpsiyonu için Penicillium chrysogenum Gömülü Süpermakrogözenekli Kriyojel Kartuşların Hazırlanması, 2018-2020 
Kaplumbağa Yuvalama Alanlarından Ağır Metallerin Uzaklaştırılması İçin Fungus Biyokütlesi Gömülü (Phema) Kriyojellerin Hazırlanması, 2019-2020 
BAP- Kan dolaşımındaki tümör hücrelerinin uzaklaştırılması için lektin bağlı kriyojellerin geliştirilmesi 2021-2022
TÜBİTAK – 1001 - 119S511 Yeni nesil plasenta modellerinin geliştirilmesi ve etkinliklerinin araştırılması 2020-2022

Yayınlar

Perçin, I., Bayrak, G., Keleş, A. F., Bereli, N., Denizli, A. Carbon dots for drug and gene delivery. Carbon Dots: Next-generation materials for biomedical applications (2022). 7-25. doi.org/10.1088/978-0-7503-4641-2ch7

Tamahkar, E., Topçu, A. A., Perçin, I., Aslıyüce, A., Denizli A. CHAPTER 1 - Bacterial cellulose nanofibers for separation, drug delivery, wound dressing, and tissue engineering applications. Nanocellulose Materials: Fabrication and Industrial Applications: Micro and Nano Technologies (2022). 1-20. https://doi.org/10.1016/B978-0-12-823963-6.00004-1

Perçin, I., İdil, N., Denizli A. Preparation of Molecularly Imprinted Poly(N-Isopropylacrylamide) Thermosensitive Based Cryogels. Affinity Chromatography (2022). 249-260. doi.org/ 10.1007/978-1-0716-2176-9_17

Kılıç, Süloğlu, A., Özkahraman, B., Özbaş, Z., Bayrak, G. Perçin, I., Kanca, Y., Boran, F., Tamahkar, E. Evaluation of kappa carrageenan and gelatin based sponges for dental application. Chemical Papers. (2022). doi.org/10.1007/s11696-022-02149-5

Varlık, S., Bayrak, G., Perçin, Demirçelik, I., Isbir, Turan, A, A. Gas Chromatography-Mass Spectroscopy Analysis and Antibacterial Tests of Hand Sanitizers Used in the Covid-19 Pandemic Period. Hittite Journal of Science and Engineering. (2022) 37-44 (9). doi.org/10.17350/HJSE19030000253

Perçin I, Aracagök YD, İdil N, Denizli A, Mattiasson B. Laccase bound to cryogel functionalized with phenylalanine for the decolorization of textile dyes. Turk J Chem (2021) 45: 1353-1365.

Bayrak G, Perçin I, Kılıç Süloğlu A, Denizli A. Amino acid functionalized macroporous gelatin cryogels: Characterization and effects on cell proliferation. Process Biochemistry, 2021, 110, 100-109.

Özbaş Z, Özkahraman B, Bayrak G, Kılıç Süloğlu A, Perçin I, Boran F, Tamahkar E.  Poly(vinyl alcohol)/(hyaluronic acid-g-kappa-carrageenan) hydrogel as antibiotic-releasing wound dressing. Chem. Pap. 2021, 75, 6591–6600.

Ozkahraman B, Özbaş Z, Bayrak G, Tamahkar E, Perçin I, Kılıç Süloğlu A, Boran F. Characterization and antibacterial activity of gelatin-gellan gum bilayer wound dressing. International Journal of Polymeric Materials and Polymeric Biomaterials, 2021. DOI: 10.1080/00914037.2021.1960341.

İdil N, Bakhshpour M, Perçin I, Mattiasson B. Whole Cell Recognition of Staphylococcus aureus Using Biomimetic SPR Sensors. Biosensors. 2021, 11(5), 140.            (1)

Peşint GB, Zenger O, Perçin I, Denizli A. Spongy membranes for peroxidase purification from Brassica oleracea roots. Process Biochemistry. 2021, 103, 98-106.                 (1)

B. Ozkahraman, E. Tamahkar, N. Idil, A. K. Suloglu & I. Percin, Evaluation of hyaluronic acid nanoparticle embedded chitosan-gelatin hydrogels for antibiotic release, Drug Development Research, 2021, 82, 241-250.

I. Percin, Y.D. Aracagok, N. Idil,  A. Denizli, A B. Mattiasson, B, Laccase bound to cryogel functionalized with phenylalanine for the decolorization of textile dyes, Turkish Journal of Chemistry, 2021, 1353-1365, 45(5).

E. Tamahkar, B. Ozkahraman, A. K. Suloglu, N. Idil & I. Percin, A novelmultilayer hydrogel wound dressing for antibiotic release, Journal of Drug Delivery Science and Technology, 2020, 1773-2247, 58.

 

Bağlantılar

Hakkında

Biyokimya bütün canlıların yapısında yer alan kimyasal maddeleri ve canlının yaşamı boyunca sürüp giden kimyasal süreçleri inceleyen bilim dalıdır. Laboratuvarımızda biyokimya alanında pek çok çalışma yürütülmektedir. Doğal veya sentetik materyaller kullanarak biyolojik sistemlerle etkileşime girebilecek malzemelere biyomalzemeler denir. Laboratuvarımızda özellikle doku mühendisliği, yara iyileşmesi ilaç taşınımı ve salımı gibi biyomedikal alanlarda son zamanlarda çok büyük önem kazanan biyomalzemelerin geliştirilmesi için çalışmalar yapılmaktadır.

Araştırma Olanakları

Hassas terazi

Santrifüj

Etüv                                               

Mikrodalga Fırın

Elektroforezler                         

 Doku Homojenizatörü

Çalkalayıcı Blok    

Çalkalamalı Isıtıcılı Kuru Blok       

-20 Dondurucular

+4 Soğutucu                                        

Rotator

PCR

Manyetik karıştırıcılar

Homojenizatör

Peristaltik pompa

Mikroskop

Araştırmacılar

Doç. Dr. Işık Perçin Demirçelik

Gülşen Bayrak (Doktora öğrencisi)

Simge Varlık (Doktora öğrencisi)

Serpil Metin (Doktora öğrencisi)

Feyza Keleş (Yüksek lisans öğrencisi)

Selin Uygun Özel (Yüksek lisans öğrencisi)

Başak Kurin (Yüksek lisans öğrencisi)

Devam Eden Projeler

Tamamlanan Projeler

TÜBİTAK 1003- 118Z601- Ağır Metal Biyosorpsiyonu için Penicillium chrysogenum Gömülü Süpermakrogözenekli Kriyojel Kartuşların Hazırlanması, 2018-2020 
Kaplumbağa Yuvalama Alanlarından Ağır Metallerin Uzaklaştırılması İçin Fungus Biyokütlesi Gömülü (Phema) Kriyojellerin Hazırlanması, 2019-2020 
BAP- Kan dolaşımındaki tümör hücrelerinin uzaklaştırılması için lektin bağlı kriyojellerin geliştirilmesi 2021-2022
TÜBİTAK – 1001 - 119S511 Yeni nesil plasenta modellerinin geliştirilmesi ve etkinliklerinin araştırılması 2020-2022

Yayınlar

Perçin, I., Bayrak, G., Keleş, A. F., Bereli, N., Denizli, A. Carbon dots for drug and gene delivery. Carbon Dots: Next-generation materials for biomedical applications (2022). 7-25. doi.org/10.1088/978-0-7503-4641-2ch7

Tamahkar, E., Topçu, A. A., Perçin, I., Aslıyüce, A., Denizli A. CHAPTER 1 - Bacterial cellulose nanofibers for separation, drug delivery, wound dressing, and tissue engineering applications. Nanocellulose Materials: Fabrication and Industrial Applications: Micro and Nano Technologies (2022). 1-20. https://doi.org/10.1016/B978-0-12-823963-6.00004-1

Perçin, I., İdil, N., Denizli A. Preparation of Molecularly Imprinted Poly(N-Isopropylacrylamide) Thermosensitive Based Cryogels. Affinity Chromatography (2022). 249-260. doi.org/ 10.1007/978-1-0716-2176-9_17

Kılıç, Süloğlu, A., Özkahraman, B., Özbaş, Z., Bayrak, G. Perçin, I., Kanca, Y., Boran, F., Tamahkar, E. Evaluation of kappa carrageenan and gelatin based sponges for dental application. Chemical Papers. (2022). doi.org/10.1007/s11696-022-02149-5

Varlık, S., Bayrak, G., Perçin, Demirçelik, I., Isbir, Turan, A, A. Gas Chromatography-Mass Spectroscopy Analysis and Antibacterial Tests of Hand Sanitizers Used in the Covid-19 Pandemic Period. Hittite Journal of Science and Engineering. (2022) 37-44 (9). doi.org/10.17350/HJSE19030000253

Perçin I, Aracagök YD, İdil N, Denizli A, Mattiasson B. Laccase bound to cryogel functionalized with phenylalanine for the decolorization of textile dyes. Turk J Chem (2021) 45: 1353-1365.

Bayrak G, Perçin I, Kılıç Süloğlu A, Denizli A. Amino acid functionalized macroporous gelatin cryogels: Characterization and effects on cell proliferation. Process Biochemistry, 2021, 110, 100-109.

Özbaş Z, Özkahraman B, Bayrak G, Kılıç Süloğlu A, Perçin I, Boran F, Tamahkar E.  Poly(vinyl alcohol)/(hyaluronic acid-g-kappa-carrageenan) hydrogel as antibiotic-releasing wound dressing. Chem. Pap. 2021, 75, 6591–6600.

Ozkahraman B, Özbaş Z, Bayrak G, Tamahkar E, Perçin I, Kılıç Süloğlu A, Boran F. Characterization and antibacterial activity of gelatin-gellan gum bilayer wound dressing. International Journal of Polymeric Materials and Polymeric Biomaterials, 2021. DOI: 10.1080/00914037.2021.1960341.

İdil N, Bakhshpour M, Perçin I, Mattiasson B. Whole Cell Recognition of Staphylococcus aureus Using Biomimetic SPR Sensors. Biosensors. 2021, 11(5), 140.            (1)

Peşint GB, Zenger O, Perçin I, Denizli A. Spongy membranes for peroxidase purification from Brassica oleracea roots. Process Biochemistry. 2021, 103, 98-106.                 (1)

B. Ozkahraman, E. Tamahkar, N. Idil, A. K. Suloglu & I. Percin, Evaluation of hyaluronic acid nanoparticle embedded chitosan-gelatin hydrogels for antibiotic release, Drug Development Research, 2021, 82, 241-250.

I. Percin, Y.D. Aracagok, N. Idil,  A. Denizli, A B. Mattiasson, B, Laccase bound to cryogel functionalized with phenylalanine for the decolorization of textile dyes, Turkish Journal of Chemistry, 2021, 1353-1365, 45(5).

E. Tamahkar, B. Ozkahraman, A. K. Suloglu, N. Idil & I. Percin, A novelmultilayer hydrogel wound dressing for antibiotic release, Journal of Drug Delivery Science and Technology, 2020, 1773-2247, 58.

 

Bağlantılar