Moleküler Biyoloji Hücre Kültürü Laboratuvarı

Hakkında

Araştırma Olanakları

•    Çeker ocak, buzdolabları, santrifüj, çalkalayıcı, heat plate, thermal cycler
•    Hücre kültürü kabini, CO2 inkübatörü, buzdolabı, soğutmalı santrifüj, ışık mikroskobu
•    Sekans cihazı, gerçek zamanlı PZR cihazı, soğutmalı santrifüj, etüv (ortak lab: Prof Dr Hatice Mergen )
•    ELISA reader, Western blot görüntüleme cihazı, Floresan Mikroskop (ortak lab 2: Prof Dr. Hatice Mergen)

Araştırmacılar

•    Doç. Dr. İbrahim Çağatay Karaaslan
•    Dr. Araş.Gör. Hayriye Akel Bilgiç
•    Araş.Gör. Başak Ezgi Saraç
•    Araş.Gör. Dilara Karagüzel
•    Sema Tuncer (D)
•    Gizem İmrak (D)
•    Seçil Subaşi (YL)
•    Selcan Genç (YL)
•    Murat Yolu (YL)
•    Büşra Kılıç (YL)
•    Emine Beyza Doğan (YL)
•    Berfin Doğa Koçkaya (YL)
•    Ali Doruk Uzunkaya (YL)

Devam Eden Projeler

•    Havayolu Hücre Kültür Sistemlerinin 3B Modellemesi ve Klinikte Kullanılması Hedeflenen Doku Greftlerinin Geliştirilmesi /2020-Devam ediyor - TÜBİTAK 1005 (Yürütücü)
•    Nonsteroid Anti-İnflamatuvar İlaçlarla Alevlenen Hava Yolu Hastalığında (N-ERD) Platelet-Lökosit Kümelerinin Rolünün Araştırılması / 2020-Devam ediyor – Hacettepe Üniversitesi Kapsamlı Araştırma Projesi (Araştırmacı)
•    Sigara dumanı kondensatı ve tert-Butil Hidroperoksit ile uyarılan insan nötrofil hücre hattında oksidatif stres ve antioksidan cevabın araştırılması / 2020-Devam ediyor – Hacettepe Üniversitesi Hızlı Destek Projesi- (Araştırmacı)
•    Şap Virüsünün Hücreye Girişinde Sindekan1’in Rolünün Araştırılması / 2020-Devam ediyor – Hacettepe Üniversitesi Yüksek Lisans Tez Projesi- (Araştırmacı)
•    Epitel Hücrelerden Alerjen İlişkili Olarak Salınan MMPler ve TIMPlerin Mekanizmasının Ve Hava Yolu Yeniden Yapılanmasına Olan Katkısının Araştırılması/ 2019-Devam ediyor- TÜBİTAK Türkiye-Polonya İkili İşbirliği
•    Havayolu Modellemesi Amaçlı Tasarlanan Mühendislik Ürünü 3B Hücre Kültür Sistemlerinin Geliştirilmesi /2019-Devam ediyor - Hacettepe Üniversitesi Tez Projesi (Yürütücü)
•    Akciğer Havayolu Modellemesine Yönelik Oluşturulan Deselülerize Doku İskeleleri İle 3b Hücre Kültür Sistemlerinin Kurulması /2019-Devam ediyor –Hacettepe Üniversitesi Hızlı Destek Projesi (Yürütücü)
•    Havayolu Epitel Hücrelerinde Dektin-1 Reseptörünün Rolü /2019-Devam ediyor – Hacettepe Üniversitesi Tez Projesi (Yürütücü)
•    Epitel Hücre Kökenli SERPINB1'in Nötrofil Elastaz İlişkili Anti-Apoptotik ve Pro-Apoptotik Yolaklar Üzerine Etkisi /2019- Devam ediyor – Hacettepe Üniversitesi Tez Projesi –(Yürütücü)

Tamamlanan Projeler

•    Oksidatif Stres Karşısında Hava Yolu İnflamatuvar ve Yapısal Hücrelerinde Antioksidan Cevabın Araştırılması /2017-2020 – Hacettepe Üniversitesi Kapsamlı Araştırma Projesi (Yürütücü)
•    Bronş Epitel Hücrelerinde Proteazla Aktive Reseptörlerin Proteaz İnhibitör İfadesi Üzerine Etkisi / 2017-2018 – Hacettepe Üniversitesi Kariyer Geçiş Projesi (Yürütücü)
•    Der p 1’la Karşılaşma Sonrası Ekspresyonu Değişen SERPINB1 ifadesinin İnflamatuvar Sitokin Kemokin ve Büyüme Faktörleri Üzerine Etkisinin BEAS2B Hücrelerinde Araştırılması / 2016-2018 – Hacettepe Üniversitesi Bilimsel Başarı Projesi
•    Bal Analizinde Yeni Nesil DNA Analizi Metodunun Kullanımı ve Validasyonu / 2017-2020 – Hacettepe Üniversitesi Kapsamlı Araştırma Projesi
•    Astımlı ve sağlıklı bronş epitelinde alerjen proteazların yol açtığı farklı SERPIN B3 ifadesinin mekanizması ve patogenetik etkileri /2015-2018 - TÜBİTAK-1001 (Yürütücü)
•    Balda DNA İzolasyonu ile Bitkisel Orijin Belirleme / 2015-2016 – Hacettepe Üniversitesi Hızlı Destek Projesi
•    Ampedus (Coleotera: Elateridae) Cinsinin Bazı Yürleri Üzerinde DNA Barkoding Çalışması / 2015-2017 – Hacettepe Üniversitesi Hızlı Destek Projesi

Yayınlar

•    Mosayyebi S., Sarac B.E., Akel H. , Sahiner U.S., Sackesen  C Kalayci O, Karaaslan C. J Interferon Cytokine Res.  Volume 40, Number 12, 2020. DOI: 10.1089/jir.2020.0172
•    Guvenir H, Buyuktiryaki B, Kulhas Celik I, Civelek E, Kilic Suloglu A, Karaaslan C, Genc S, Dibek Misirlioglu E, Toyran M, Ginis T, Kocabas CN. Can serum periostin, YKL-40, and osteopontin levels in pre-school children with recurrent wheezing predict later development of asthma? Pediatr Allergy Immunol . 2020 Aug 12. doi: 10.1111/pai.13329.
•    Acar NV, Cavkaytar O, Yilmaz EA, Buyuktiryaki B, Soyer O, Sahiner UM, Sekerel BE, Karaaslan C, Sackesen C. Rare occurrence of common filaggrin mutations in Turkish children with food allergy and atopic dermatitis. Turk J Med Sci . 2020 Jun 15. doi: 10.3906/sag-1910-162.
•    Bilgic HA, Gurel SC, Ayhan Y, Karahan S, Karakaya I, Babaoglu M, Dilbaz N, Ulug B, Demir B, Karaaslan C. Relationship Between Alcohol Dependence and Neuropeptide Y (NPY) Gene Promoter Polymorphisms in A Turkish Sample. Turkish Journal of Psychiatry.  2020;31(4):233-40
•    Radzikowska, U.; Rinaldi, A.O.; Çelebi Sözener, Z.; Karaguzel, D.; Wojcik, M.; Cypryk, K.; Akdis, M.; Akdis, C.A.; Sokolowska, M. The Influence of Dietary Fatty Acids on Immune Responses. Nutrients 2019, 11, 2990.
•    Emine Sonmez H, Karaaslan C, de Jesus AA, Deniz Batu E, Anlar B, Sözeri B, Bilginer Y, Karaguzel D, Cagdas Ayvaz D, Tezcan I, Goldbach-Mansky R, Ozen S. A clinical score to guide in decision making for monogenic type I IFNopathies. Pediatr Res. 2019 Oct 22. doi: 10.1038/s41390-019-0614-2.
•    Süloğlu AK, Karacaoğlu E, Bilgic HA, Selmanoğlu G, Koçkaya EA, Karaaslan C. Osteogenic Differentiation of Adipose Tissue-derived Mesenchymal Stem Cells on Fibrin Glue or Fibronectin Coated Ceraform®   J Biomater Appl. 2019 Jun 5:885328219853421.
•    Çetinkaya P, Karagüzel D,  Esenboğa S, Şahiner Ü,  Soyer OU, Büyüktiryaki B, Birben E, Karaaslan C,  Şekerel B., Pistachio and Cashew Nut Allergy in Childhood: Predictive Factors Towards Development of a Decision Tree. Asian Pac J Allergy Immunol. 2019 Jul 16. doi: 10.12932/AP-281018-0429. Online ahead of print.
•    Ugurlu N., Asık M.D, Çakmak H.B., Tuncer S., Turk M., Çağıl N., and Denkbaş E.B., ‘‘Transscleral Delivery of Bevacizumab Loaded Chitosan Nanoparticles’’, Journal of Biomedical Nanotechnology, 2019.
•    Keskin O, Farzan N, Birben E, Akel H, Karaaslan C, Maitland-van der Zee AH, Wechsler ME, Vijverberg SJ, Kalayci O Genetic associations of the response to inhaled corticosteroids in asthma: a systematic review. Clin Transl Allergy. 2019 Jan 9;9:2. doi: 10.1186/s13601-018-0239-2.
•    Berings M, Karaaslan C*, Altunbulakli C, Gevaert P, Akdis M, Bachert C, Akdis CA. Advances and Highlights in Allergen Immunotherapy: On the way to sustained clinical and immunologic tolerance. J Allergy Clin Immunol. 2017 Nov;140(5):1250-1267. doi: 10.1016/j.jaci.2017.08.025. Epub 2017 Sep 20.
•    Sungur T, Aslim B, Karaaslan C, Aktas B. Impact of Exopolysaccharides (EPSs) of Lactobacillus gasseri strains isolated from human vagina on cervical tumor cells (HeLa). Anaerobe. 2017 May 26;47:137-144.
•    Gürel Ş. C., Ayhan Y., Karaaslan C., Akel H., Babaoğlu M., Yaşar Ü., Bozkurt A., Dilbaz N., Uluğ B. D., Demir B., Karaca R., Ö. µ-Opioid Receptor Gene (OPRM1) Polymorphisms A118G and C17T in Alcohol Dependence. Turk Psikiyatri Derg. 2016 Summer;27(2):0. DOI: 10.5080/u12336.
•    Kılıç Süloğlu A, Karacaoğlu E., Selmanoğlu G., Akel H, Karaaslan C. Evaluation of apoptotic cell death mechanisms induced by hypericin mediated photodynamic therapy in colon cancer cells. Turkish Journal of Biology (2016) 40: 539-546 DOI: 10.3906/biy-1504-6.
•    Yu CW, Liang X, Lipsky S, Karaaslan C, Kozakewich H, Hotamisligil GS, Bischoff J, Cataltepe S. Dual role of fatty acid-binding protein 5 on endothelial cell fate: a potential link between lipid metabolism and angiogenic responses. Angiogenesis. 2016 Jan;19(1):95-106. doi: 10.1007/s10456-015-9491-4. Epub 2015 Dec 1.

Bağlantılar

Resmi Web Adresi
asthmalab18.wixsite.com/cagataykaraaslan

Hakkında

Araştırma Olanakları

•    Çeker ocak, buzdolabları, santrifüj, çalkalayıcı, heat plate, thermal cycler
•    Hücre kültürü kabini, CO2 inkübatörü, buzdolabı, soğutmalı santrifüj, ışık mikroskobu
•    Sekans cihazı, gerçek zamanlı PZR cihazı, soğutmalı santrifüj, etüv (ortak lab: Prof Dr Hatice Mergen )
•    ELISA reader, Western blot görüntüleme cihazı, Floresan Mikroskop (ortak lab 2: Prof Dr. Hatice Mergen)

Araştırmacılar

•    Doç. Dr. İbrahim Çağatay Karaaslan
•    Dr. Araş.Gör. Hayriye Akel Bilgiç
•    Araş.Gör. Başak Ezgi Saraç
•    Araş.Gör. Dilara Karagüzel
•    Sema Tuncer (D)
•    Gizem İmrak (D)
•    Seçil Subaşi (YL)
•    Selcan Genç (YL)
•    Murat Yolu (YL)
•    Büşra Kılıç (YL)
•    Emine Beyza Doğan (YL)
•    Berfin Doğa Koçkaya (YL)
•    Ali Doruk Uzunkaya (YL)

Devam Eden Projeler

•    Havayolu Hücre Kültür Sistemlerinin 3B Modellemesi ve Klinikte Kullanılması Hedeflenen Doku Greftlerinin Geliştirilmesi /2020-Devam ediyor - TÜBİTAK 1005 (Yürütücü)
•    Nonsteroid Anti-İnflamatuvar İlaçlarla Alevlenen Hava Yolu Hastalığında (N-ERD) Platelet-Lökosit Kümelerinin Rolünün Araştırılması / 2020-Devam ediyor – Hacettepe Üniversitesi Kapsamlı Araştırma Projesi (Araştırmacı)
•    Sigara dumanı kondensatı ve tert-Butil Hidroperoksit ile uyarılan insan nötrofil hücre hattında oksidatif stres ve antioksidan cevabın araştırılması / 2020-Devam ediyor – Hacettepe Üniversitesi Hızlı Destek Projesi- (Araştırmacı)
•    Şap Virüsünün Hücreye Girişinde Sindekan1’in Rolünün Araştırılması / 2020-Devam ediyor – Hacettepe Üniversitesi Yüksek Lisans Tez Projesi- (Araştırmacı)
•    Epitel Hücrelerden Alerjen İlişkili Olarak Salınan MMPler ve TIMPlerin Mekanizmasının Ve Hava Yolu Yeniden Yapılanmasına Olan Katkısının Araştırılması/ 2019-Devam ediyor- TÜBİTAK Türkiye-Polonya İkili İşbirliği
•    Havayolu Modellemesi Amaçlı Tasarlanan Mühendislik Ürünü 3B Hücre Kültür Sistemlerinin Geliştirilmesi /2019-Devam ediyor - Hacettepe Üniversitesi Tez Projesi (Yürütücü)
•    Akciğer Havayolu Modellemesine Yönelik Oluşturulan Deselülerize Doku İskeleleri İle 3b Hücre Kültür Sistemlerinin Kurulması /2019-Devam ediyor –Hacettepe Üniversitesi Hızlı Destek Projesi (Yürütücü)
•    Havayolu Epitel Hücrelerinde Dektin-1 Reseptörünün Rolü /2019-Devam ediyor – Hacettepe Üniversitesi Tez Projesi (Yürütücü)
•    Epitel Hücre Kökenli SERPINB1'in Nötrofil Elastaz İlişkili Anti-Apoptotik ve Pro-Apoptotik Yolaklar Üzerine Etkisi /2019- Devam ediyor – Hacettepe Üniversitesi Tez Projesi –(Yürütücü)

Tamamlanan Projeler

•    Oksidatif Stres Karşısında Hava Yolu İnflamatuvar ve Yapısal Hücrelerinde Antioksidan Cevabın Araştırılması /2017-2020 – Hacettepe Üniversitesi Kapsamlı Araştırma Projesi (Yürütücü)
•    Bronş Epitel Hücrelerinde Proteazla Aktive Reseptörlerin Proteaz İnhibitör İfadesi Üzerine Etkisi / 2017-2018 – Hacettepe Üniversitesi Kariyer Geçiş Projesi (Yürütücü)
•    Der p 1’la Karşılaşma Sonrası Ekspresyonu Değişen SERPINB1 ifadesinin İnflamatuvar Sitokin Kemokin ve Büyüme Faktörleri Üzerine Etkisinin BEAS2B Hücrelerinde Araştırılması / 2016-2018 – Hacettepe Üniversitesi Bilimsel Başarı Projesi
•    Bal Analizinde Yeni Nesil DNA Analizi Metodunun Kullanımı ve Validasyonu / 2017-2020 – Hacettepe Üniversitesi Kapsamlı Araştırma Projesi
•    Astımlı ve sağlıklı bronş epitelinde alerjen proteazların yol açtığı farklı SERPIN B3 ifadesinin mekanizması ve patogenetik etkileri /2015-2018 - TÜBİTAK-1001 (Yürütücü)
•    Balda DNA İzolasyonu ile Bitkisel Orijin Belirleme / 2015-2016 – Hacettepe Üniversitesi Hızlı Destek Projesi
•    Ampedus (Coleotera: Elateridae) Cinsinin Bazı Yürleri Üzerinde DNA Barkoding Çalışması / 2015-2017 – Hacettepe Üniversitesi Hızlı Destek Projesi

Yayınlar

•    Mosayyebi S., Sarac B.E., Akel H. , Sahiner U.S., Sackesen  C Kalayci O, Karaaslan C. J Interferon Cytokine Res.  Volume 40, Number 12, 2020. DOI: 10.1089/jir.2020.0172
•    Guvenir H, Buyuktiryaki B, Kulhas Celik I, Civelek E, Kilic Suloglu A, Karaaslan C, Genc S, Dibek Misirlioglu E, Toyran M, Ginis T, Kocabas CN. Can serum periostin, YKL-40, and osteopontin levels in pre-school children with recurrent wheezing predict later development of asthma? Pediatr Allergy Immunol . 2020 Aug 12. doi: 10.1111/pai.13329.
•    Acar NV, Cavkaytar O, Yilmaz EA, Buyuktiryaki B, Soyer O, Sahiner UM, Sekerel BE, Karaaslan C, Sackesen C. Rare occurrence of common filaggrin mutations in Turkish children with food allergy and atopic dermatitis. Turk J Med Sci . 2020 Jun 15. doi: 10.3906/sag-1910-162.
•    Bilgic HA, Gurel SC, Ayhan Y, Karahan S, Karakaya I, Babaoglu M, Dilbaz N, Ulug B, Demir B, Karaaslan C. Relationship Between Alcohol Dependence and Neuropeptide Y (NPY) Gene Promoter Polymorphisms in A Turkish Sample. Turkish Journal of Psychiatry.  2020;31(4):233-40
•    Radzikowska, U.; Rinaldi, A.O.; Çelebi Sözener, Z.; Karaguzel, D.; Wojcik, M.; Cypryk, K.; Akdis, M.; Akdis, C.A.; Sokolowska, M. The Influence of Dietary Fatty Acids on Immune Responses. Nutrients 2019, 11, 2990.
•    Emine Sonmez H, Karaaslan C, de Jesus AA, Deniz Batu E, Anlar B, Sözeri B, Bilginer Y, Karaguzel D, Cagdas Ayvaz D, Tezcan I, Goldbach-Mansky R, Ozen S. A clinical score to guide in decision making for monogenic type I IFNopathies. Pediatr Res. 2019 Oct 22. doi: 10.1038/s41390-019-0614-2.
•    Süloğlu AK, Karacaoğlu E, Bilgic HA, Selmanoğlu G, Koçkaya EA, Karaaslan C. Osteogenic Differentiation of Adipose Tissue-derived Mesenchymal Stem Cells on Fibrin Glue or Fibronectin Coated Ceraform®   J Biomater Appl. 2019 Jun 5:885328219853421.
•    Çetinkaya P, Karagüzel D,  Esenboğa S, Şahiner Ü,  Soyer OU, Büyüktiryaki B, Birben E, Karaaslan C,  Şekerel B., Pistachio and Cashew Nut Allergy in Childhood: Predictive Factors Towards Development of a Decision Tree. Asian Pac J Allergy Immunol. 2019 Jul 16. doi: 10.12932/AP-281018-0429. Online ahead of print.
•    Ugurlu N., Asık M.D, Çakmak H.B., Tuncer S., Turk M., Çağıl N., and Denkbaş E.B., ‘‘Transscleral Delivery of Bevacizumab Loaded Chitosan Nanoparticles’’, Journal of Biomedical Nanotechnology, 2019.
•    Keskin O, Farzan N, Birben E, Akel H, Karaaslan C, Maitland-van der Zee AH, Wechsler ME, Vijverberg SJ, Kalayci O Genetic associations of the response to inhaled corticosteroids in asthma: a systematic review. Clin Transl Allergy. 2019 Jan 9;9:2. doi: 10.1186/s13601-018-0239-2.
•    Berings M, Karaaslan C*, Altunbulakli C, Gevaert P, Akdis M, Bachert C, Akdis CA. Advances and Highlights in Allergen Immunotherapy: On the way to sustained clinical and immunologic tolerance. J Allergy Clin Immunol. 2017 Nov;140(5):1250-1267. doi: 10.1016/j.jaci.2017.08.025. Epub 2017 Sep 20.
•    Sungur T, Aslim B, Karaaslan C, Aktas B. Impact of Exopolysaccharides (EPSs) of Lactobacillus gasseri strains isolated from human vagina on cervical tumor cells (HeLa). Anaerobe. 2017 May 26;47:137-144.
•    Gürel Ş. C., Ayhan Y., Karaaslan C., Akel H., Babaoğlu M., Yaşar Ü., Bozkurt A., Dilbaz N., Uluğ B. D., Demir B., Karaca R., Ö. µ-Opioid Receptor Gene (OPRM1) Polymorphisms A118G and C17T in Alcohol Dependence. Turk Psikiyatri Derg. 2016 Summer;27(2):0. DOI: 10.5080/u12336.
•    Kılıç Süloğlu A, Karacaoğlu E., Selmanoğlu G., Akel H, Karaaslan C. Evaluation of apoptotic cell death mechanisms induced by hypericin mediated photodynamic therapy in colon cancer cells. Turkish Journal of Biology (2016) 40: 539-546 DOI: 10.3906/biy-1504-6.
•    Yu CW, Liang X, Lipsky S, Karaaslan C, Kozakewich H, Hotamisligil GS, Bischoff J, Cataltepe S. Dual role of fatty acid-binding protein 5 on endothelial cell fate: a potential link between lipid metabolism and angiogenic responses. Angiogenesis. 2016 Jan;19(1):95-106. doi: 10.1007/s10456-015-9491-4. Epub 2015 Dec 1.

Bağlantılar

Resmi Web Adresi
asthmalab18.wixsite.com/cagataykaraaslan