Tıbbi ve Endüstriyel Biyoteknoloji Laboratuvarı bünyesinde farklı mikrobiyal kaynaklardan çeşitli enzimlerin ve hormanların üretimi gerçekleştirilmektedir. Bunlar arasında; deterjan sanayinde kullanılan proteaz, lipaz ve amilaz, gıda sanayinde kullanılan laktaz, meyve ve sebze teknolojilerinde kullanılan pektinaz, yem ve kağıt sanayinde kullanılan ksilanaz, selülaz, ligninaz ve tirosinaz gini çeşitli enzimlerin üretimi yer almaktadır. Ayrıca ko-immobilize olarak tasarlanmış enzimler ile kirlenmiş suların temizlenmesine yönelik çalışmalarda mevcuttur. Söz konusu laboratuvar bünyesinde mikrobiyal kaynaklı üretilen selüloz, biyosürfektan ve pigmentler gibi çeşitli biyoteknolojik ürünlerin üretimi ve çeşitli endüstiryel alanlarda kullanımları gerçekleşmektedir. Bununla beraber, çeşitli bitkisel kaynaklı yağların anti-fungal, anti-bakteriyel ve anti-biyofilm etkileri de araştırma alanları arasındadır. Moleküler baskılama yöntemiyle tıbbi tanı amaçlı biyosensör geliştirilmesi de güncel çalışmalar arasında bulunmaktadır. Mikroorganizmalar aracılığıyla geliştirilmiş petrol ve siyanür biyoyıkımı gibi biyoremediasyon temelli biyoteknolojik çalışmalarda yürütülmektedir.
• Sıcak Su Banyosu (Memert Marka)
• Mikroskop (2 Adet) (Leica Marka)
• Santrifüj (Eppendorf Marka 5417c Model)
• Buzdolabı (AEG Marka)
• Vortex (Ika Marka Genius 3 Mode)
• Hassas Terazi (Ika Marka Rct Basic Model)
• Hassas Terazi (Yellowline Marka Mst Digital Model)
• pH Metre (Schott Marka)
• pH Metre (Consort Marka)
• Isıtıcılı Manyetik Karıştırıcı
• Prof. Dr. Işıl Seyis Bilkay
• Araş. Gör. Dr. Hande Avcıoğlu
• Araş. Gör. Dr. Sinem Diken Gür
• Araş. Gör. Dr. Sezen Bilen Özyürek
• Araş. Gör. Dr. Gülcan Şahal
• Kaan Soyuer
• Cansu Köten
Yüzey Plazmon Nanosensör ile Glikoprotein Tayini, HACETTEPE ÜNİVERSİTESİ BİLİMSEL ARAŞTIRMA PROJELERİ KOORDİNASYON BİRİMİ, (2019-Devam ediyor.)
Endüstriyel Atıklar ile Üretilecek Biyosürfektanların Antimikrobiyal ve Antibiyofilm Etkilerinin Araştırılması, TÜBİTAK 2209/A ÜNİVERSİTE ÖĞRENCİLERİ ARAŞTIRMA PROJELERİ DESTEK PROGRAMI, 1919B012000647, (Devam ediyor).
Bitkisel madde içerikli hidrojel ve mikrobiyal selülozların antimikrobiyal ve antibiyofilm etkileri ile sitotoksik potansiyellerinin araştırılması, HACETTEPE ÜNİVERSİTESİ BİLİMSEL ARAŞTIRMA PROJELERİ KOORDİNASYON BİRİMİ, (2020-Devam ediyor).
Karadeniz’ de Doğal Gaz Sondaj Platformundaki Sondaj Kesintilerinden İzole Edivlecek Mikrobiyal Konsorsiyumların Petrol Biyoyıkım ve Biyosürfektan Üretim Etkinliklerinin Araştırılması, TÜBİTAK 1002 HIZLI DESTEK PROJESİ, (2021- Devam Ediyor)
• Klebsiella Pneumoniae ve Klebsiella Ornithinolytica Türleri ile Siyanür Biyoyıkımının Araştırılması, HACETTEPE ÜNİVERSİTESİ BİLİMSEL ARAŞTIRMA PROJELERİ KOORDİNASYON BİRİMİ, 2015.
• İki Farklı Destek Materyal ile Koimmobilize Enzim Tasarımı, HACETTEPE ÜNİVERSİTESİ BİLİMSEL ARAŞTIRMA PROJELERİ KOORDİNASYON BİRİMİ, Hızlı Destek Projesi, 2015.
• Atık su Ön Arıtımı İçin Koimmobilize Enzim Tasarımı, HACETTEPE ÜNİVERSİTESİ BİLİMSEL ARAŞTIRMA PROJELERİ KOORDİNASYON BİRİMİ, Tez Projesi (Doktora), 2016.
• Ham petrol, sondaj çamuru ve çamur çukurundan izole edilen bakteriler ile petrol biyoyıkımının araştırılması, HACETTEPE ÜNİVERSİTESİ BİLİMSEL ARAŞTIRMA PROJELERİ KOORDİNASYON BİRİMİ, Hızlı Destek Projesi, 2016.
• Farklı Klinik Candida Suşlarının Çeşitli Malzemeler Üzerinde Oluşturdukları Biyofilmlerin ve Bu Biyofilmler Üzerine Etkisi Olan Farklı Bitkisel Maddelerin Araştırılması, HACETTEPE ÜNİVERSİTESİ BİLİMSEL ARAŞTIRMA PROJELERİ KOORDİNASYON BİRİMİ, Doktora Tez Projesi, 2016.
• Fungal Kaynaklar ile Siyanür Biyoyıkımının İncelenmesi, HACETTEPE ÜNİVERSİTESİ BİLİMSEL ARAŞTIRMA PROJELERİ KOORDİNASYON BİRİMİ, 2017.
• Ham petrol, sondaj çamuru ve çamur çukurundan izole edilen mikroorganizmalar ile çeşitli hidrokarbonların biyoyıkımının araştırılması, HACETTEPE ÜNİVERSİTESİ BİLİMSEL ARAŞTIRMA PROJELERİ KOORDİNASYON BİRİMİ, Doktora Tez Projesi, 2017.
• Petrol bulaşmış atık çamur çukuruna adapte olmuş bakteriyel konsorsiyumların petrol biyoyıkımına etkilerinin araştırılması, HACETTEPE ÜNİVERSİTESİ BİLİMSEL ARAŞTIRMA PROJELERİ KOORDİNASYON BİRİMİ, Hızlı Destek Projesi, (2017-2018).
• Yüzey Plazmon Rezonans Biyosensör ile Escherichia coli Tayini, HACETTEPE ÜNİVERSİTESİ BİLİMSEL ARAŞTIRMA PROJELERİ KOORDİNASYON BİRİMİ, Hızlı Destek Projesi, 2018.
• Çeşitli Esansiyal Yağlar içeren Polikaprolakton Nanofiberlerin Faklı Candida Türleri Üzerindeki Antibiyofilm Etkilerinin Araştırılması, HACETTEPE ÜNİVERSİTESİ BİLİMSEL ARAŞTIRMA PROJELERİ KOORDİNASYON BİRİMİ, Hızlı Destek Projesi, 2018.
• Petrol Sahasından İzole Edilecek Bakteriyel Suşlar ile Biyosürfektan Üretiminin Araştırılması, TÜBİTAK 2209/A ÜNİVERSİTE ÖĞRENCİLERİ ARAŞTIRMA PROJELERİ DESTEK PROGRAMI, 1919B011900736, (2019-2020).
• Selülozun Siyanür ve Boya Gideriminde Kullanımının Araştırılması, HACETTEPE ÜNİVERSİTESİ BİLİMSEL ARAŞTIRMA PROJELERİ KOORDİNASYON BİRİMİ, 2020.
• Avcioglu, N.H., Sahal, G., Bilkay, I., Investigation of Biofilm Formation in Clinically Acquired Escherichia coli Strains,Hacettepe J. Biol. & Chem., (2015), 43 (1), 43–48,
• Avcioglu, N.H., Seyis Bilkay, I., Assessment of five clinical Klebsiella isolates in terms of antibiotic resistance and plasmid profiles, Turkish Journal of Biochemistry, (2015), 40 (6), 448-455,
• Bilen Ozyurek, S., Seyis Bilkay, I. Determination of resistance in Pseudomonas aeruginosa strains against beta lactam aminoglycoside and ciprofloxacin group antibiotics, Hacettepe Journal of Biology & Chemistry, (2015), 43, 59-67.
• Sahal G., Nasseri B., Bilkay Seyis I., Piskin E. “Anti-Biofilm Effect of Nanometer Scale Silver (NmSAg) Coatings on Glass and Polystyrene Surfaces Against Clinical P. mirabilis, C. glabrata and C. tropicalis Strains.” J Appl Biomater Funct Mater., (2015), 13(4), 351-355.
• Sahal G., Bilkay Seyis I.; Multidrug resistance by biofilm-forming clinical strains of Proteus mirabilis., Asian Biomedicine (2015), 9(4), 535-541.
• Avcioglu, N.H., Sahal, G., Bilkay, I., Antibiofilm Effects of Citrus limonum and Zingiber officinale oils on biofilm formation of Klebsiella ornithinolytica, Klebsiella oxytoca and Klebsiella terrigena species, African Journal of Traditional, Complementary and Alternative Medicines, (2016), 13(6):61-67.
• Avcioglu, N.H., Seyis Bilkay, I., Biological Treatment of Cyanide by Using Klebsiella pneumoniae Species, Food Technology and Biotechnology, (2016), 54 (4), 450-454.
• Sahal, G., Avcioglu, N.H., Seyis Bilkay, I., Higher Biofilm Formation by Multi-Drug Resistant K. pneumoniae and K. rhinoscleromatis Strains and Effects of Lemon and Ginger Essential Oils on Biofilm Formation, Indian Journal of Pharmaceutical Education and Research, (2016), 50 (2), 82-88.
• Avcioglu, N.H., Seyis Bilkay, I., Resistance, multidrug resistance and enterobacterial repetitive intergenic consensus polymerase chain reaction profiles of clinically important Klebsiella species, Asian Biomedicine, (2016), 10 (1), 41-47.
• Diken Gür S., Aksöz, N., “Molecular typing of clinical Pseudomonas aeruginosa strains by using RAPD-PCR”, Minerva Biotecnologica, (2016), 28(2); 104-13.
• Bilen Ozyurek, S., Seyis Bilkay I., Determining the distribution of the bla (VIM) gene in imipenem-resistant Pseudomonas aeruginosa strains isolated from three different hospitals, Minerva Biotecnologica, (2016), 28, 52-58.
• Bilen Ozyurek, S., Diken Gur, S., Seyis Bilkay, I. Investigation of antimicrobial activity of pyocyanin produced by Pseudomonas aeruginosa strains isolated from different clinical specimens, Hacettepe Journal of Biology & Chemistry, (2016), 44 (1), 1-6.
• Bilen Ozyurek, S., Seyis Bilkay I. Determination of petroleum biodegradation by bacteria isolated from drilling fluid, waste mud pit and crude oil. Turkish Journal of Biochemistry, (2017), 42 (6), 609–616. https://doi.org/10.1515/tjb-2017-0087.
• Bilen Ozyurek, S., Seyis Bilkay, I., Determination of petroleum biodegradation by oil field isolated microorganisms, Journal of Biotechnology, (2017), 256, S23. (Abstract)
• Diken Gur, S., Bilen Ozyurek, S., Seyis Bilkay, I. Antimicrobial activity of thyme and rosemary oils against Pseudomonas aeruginosa strains, Hacettepe Journal of Biology & Chemistry, (2017), 45 (3), 2017, 435–442.
• Avcioglu, N.H., Seyis Bilkay, I., Removal of Cyanide Compounds and Soil Cyanide by Klebsiella oxytoca, Hacettepe J. Biol. & Chem., (2017), 45 (4), 523–531.
• Bilen Ozyurek, S., Seyis Bilkay, I. Biodegradation of petroleum by Klebsiella pneumoniae isolated from drilling fluid, International Journal of Environmental Science and Technology, (2018), 15, 2107-2116. https://doi.org/10.1007/s13762-017-1581-y.
• Diken Gur S., Idil N., Aksöz N., ''Optimization of Enzyme Co-immobilization with Sodium Alginate and Glutaraldehyde-Activated Chitosan Beads'', Applied Biochemistry and Biotechnology, (2018), 184 (2); 538-552.
• Sahal G., Bilkay Seyis I.; Distribution of clinical isolates of Candida spp. and antifungal susceptibility of high biofilm forming Candida isolates, Journal of the Brazilian Society of Tropical Medicine, (2018), 51(5), 644-650.
• Diken Gür S., Bakhshpour M., Denizli A., “Selective Detection of Escherichia coli Caused UTIs with Surface Imprinted Plasmonic Nanoscale Sensor’’, Materials Science and Engineering:C, (2019), 104; 109869.
• Sahal, G., Nasseri, B., Ebrahimi, A., Bilkay, I.S.; Electrospun essential oil-polycaprolactone nanofibers as antibiofilm surfaces against clinical Candida tropicalis isolates. Biotechnol Lett, (2019), 41(4-5): 511-522.
• Avcioglu, N.H., Seyis Bilkay, I., Removal in Electroplating, Metal Plating and Gold Mining Industries’ Wastewaters by Using Klebsiella pneumoniae and Klebsiella oxytoca Species, European Journal of Biology, (2019), 78(1): 5-10,.
• Bilen Ozyurek, S., Avcioglu, N.H., The Role of Aspergillus parasiticus NRRL: 3386 Strain on Petroleum Biodegradation and Biosorption Processes, European Journal of Biology, 2020 (In Press).
• Bilen Ozyurek, S., Seyis Bilkay, I. Comparison of petroleum biodegradation efficiencies of three different bacterial consortia determined in petroleum‑contaminated waste mud pit, SN Applied Sciences, (2020), 2(272), 1-12. https://doi.org/10.1007/s42452-020-2044-5.
• Sahal, G., Woerdenbag, H. J., Hinrichs, W. L. J., Visser, A., Tepper, P. G., Quax, W. J., van der Mei, H.C., Bilkay, I.S.; Antifungal and biofilm inhibitory effect of Cymbopogon citratus (lemongrass) essential oil on biofilm forming by Candida tropicalis isolates; an in vitro study. J Ethnopharmacol, (2020), 246: 112188.
• Donmez H.G., Sahal, G., Akgor, U., Cagan, M., Ozgul, N., Beksac, M.S.; The relationship between the presence of HPV infection and biofilm formation in cervicovaginal smears. Infection (2020), 48 (5), 735-740.
• Sahal, G., Woerdenbag, H. J., Hinrichs, W. L. J., Visser, A., van der Mei, H. C. and Bilkay, I.S.; Candida Biofilm Formation Assay on Essential Oil Coated Silicone Rubber. Bio-Protocol (In Press).